Description du poste

L’observation des écosystèmes côtiers par imagerie optique s’est fortement développée depuis quelques années. L’Ifremer acquiert des données in situ d’imagerie optique depuis plus de 20 ans et possède de nombreuses images
et données résultant de leur analyse.

Ce travail s’intéressera à des données issues de deux protocoles d’imagerie utilisées en écologie marine
et halieutique : a) le PAGURE, un traineau remorqué derrière un navire de recherche et qui permet de suivre les habitats et organismes vivants posés sur le fond et b) le STAVIRO/MICADO qui sert à caractériser les habitats côtiers et dénombrer les poissons qui y vivent. Pour le PAGURE plus de 200 plongées ont été réalisées et analysées de la mer du Nord à la Méditerranée. Pour le STAVIRO/MICADO, ce sont environ 5000 observations qui ont été collectées
et analysées en Nouvelle-Calédonie, à la Réunion, Mayotte, en Méditerranée et en Atlantique.

Dans ce cadre, vous aurez pour mission de :

  1. Formaliser les besoins en annotation d’image pour les données issues du STAVIRO
    et du PAGURE, deux systèmes d’observation largement utilisés à Ifremer. Cette étape suppose
    de se familiariser avec les images en question et la finalité de leur collecte, et ce en étroite interaction avec les producteurs et utilisateurs de ces données. Le résultat de cette étape sera
    un cahier des charges spécifiant les besoins inhérents aux données;
  2. Rechercher des programmes informatiques, méthodes et autres ressources utiles
    pour l’annotation des images. Cette étape requiert : a) d’organiser et de mettre en œuvre
    des recherches, en ligne et auprès des collaborateurs dans la communauté scientifique ;
    b) de comprendre les programmes pour sélectionner les plus pertinents.

Le résultat de cette synthèse fera l’objet d’un rapport technique.

  1. Tester les outils identifiés sur les jeux de données. Cette étape nécessite de définir les résultats souhaités, les critères d’évaluation de la qualité de ces résultats, de sélectionner les données
    les plus pertinentes pour les tests, et d’adapter les codes des programmes au cas d’utilisation
    pour atteindre ces objectifs. Le résultat de cette étape fera l’objet d’un rapport technique
    et si possible d‘une publication scientifique.

Modalités de candidature

CANDIDATURE EN LIGNE

Date de clôture de réception de candidatures : 18/06/2021